在一定溫度下，壓力越低，氣體分子的平均自由程越大。當蒸發空間的壓力很低(100～10000mmHg)，且使冷凝表面靠近蒸發表面，其間的垂直距離小于氣體分子的平均自由程時，從蒸發表面汽化的蒸氣分子，可以不與其他分子碰撞，直接到達冷凝表面而冷凝。當液體混合物沿加熱板流動并被加熱，輕、重分子會逸出液面而進入氣相，由于輕、重分子的自由程不同，因此，不同物質的分子從液面逸出后移動距離不同，若能恰當地設置一塊冷凝板，則輕分子達到冷凝板被冷凝排出，而重分子達不到冷凝板沿混合液排出。這樣，達到物質分離的目的。

　　在進行分子蒸餾的過程中，多因素都會影響分子蒸餾設備的作業能力，其中較為明顯的就是進料位置和填料種類。正是因為如此，在設計分子蒸餾裝置的時候，一定要謹慎。

　　當分子蒸餾設備在運用不同種類填料的情況下，分離效果也是不一樣的，根據裝填方式可分為散裝填料和規整填料，與同樣尺寸相比，鮑爾環在分子蒸餾裝置中的氣液通量高，分離效果也好。

　　蒸餾操作是一項重要的前處理步驟。傳統的蒸餾設備，其加熱、蒸餾、冷凝、接收部分等各自分工，操作繁瑣，效率較低；且由于缺乏蒸餾終點控制，常導致蒸餾失敗，影響工作效率，而且明火加熱易爆瓶，操作危險。短程分子蒸餾儀的出現讓蒸餾操作變得那么的簡單。

　　短程分子蒸餾是一種液-液分離技術，它能在真空下操作，能使液體在遠低于其沸點的溫度下將其分離。主要由加熱、蒸餾、冷卻水以及接收裝置四部組成，按操作條件可分為常壓、減壓或高真空蒸餾；利用分子運動平均自由程的原理，將液體混合物稍稍加熱，使液體分子從液面逸出，輕分子落在冷凝面而重分子又返回，這樣就將液體分離了。